肛门、直肠尖锐湿疣与其他部位HPV感染一样，是先明确病发的途径，主要是通过直接接触传染，也有少数通过间接接触感染，目前主要包括同性接触、异性接触、自身接种传播、公共场所间接接触感染及一些其他少数途径。
同性接触、及异性性接触是最重要的途径，顾名思义，就是同性或者异性有肛门性行为，该类患者多数直肠和肛门同时感染HPV，治疗相对困难，复发率高，治疗周期长。
自身接种传播主要是指有阴茎或者外阴尖锐湿疣的患者，蔓延或者自身个人接触传染至肛周，该类患者多数疣体局限在肛周，数量相对少，但长时间未引起重视的也可能增多甚至蔓延至直肠。
公共场所间接接触感染包括公共浴室使用公用座位或者毛巾等引起的HPV感染，该类患者多数局部皮肤有破损，如有严重的股癣、肛裂、痔疮等基础病，感染后也是多发上在肛周，数量较少，该类属于极少数人群的感染。
肛门直肠尖锐湿疣容易被忽略，同时也易被误认为是痔疮，导致患者不能及时就诊，常常进展的很严重才到医院被确诊，同时因为患者自己外用药物及检查复发的不便，也使该类患者病程更长，复发率更高，患者备受折磨。
？肛门直肠尖锐湿疣的治疗与其他部位一样，包括物理治疗如手术、CO2激光、冷冻、电灼、光动力等；化学治疗如鬼臼毒素、苯酚、三氯醋酸、咪喹莫特乳膏、干扰素乳膏、中药制剂等；系统治疗如注射干扰素、胸腺肽等。
对于而言，大多数药物治疗时可以减缓疣体的生长速度，化学疗法根据药物的刺激性强弱可以用于微小疣体的清除；物理疗法作为最主要的治疗方法，虽然去除疣体很快，但复发率相当高。这些治疗方法都存在明显缺陷，如：激光创伤大，
防复发效果差；光动力治疗较大疣体价格昂贵，且有较高的复发几率；鬼臼毒素治疗较大疣体效果差，对正常皮肤损伤也很大好。