在使用时，毛刷的好坏起到重要的作用，如果使用的质量不好的毛刷会起到意想不到的后果。
洗车机毛刷是自动洗车机中最为重要的组成部分，也是唯一与车漆面进行直接接触的部件。毛刷质量的好坏直接影响到洗车质量。该问题短期内用户不会察觉，劣质毛刷在连续使用一个月后，会使车辆的光泽度大大降低。中国洗车机市场上的洗车毛刷按时间的先后顺序可大致分为布刷、棉刷、纤维刷、泡沫刷四种。
最好为布刷，该毛刷材料最早于上世纪90年代由日本传入台湾，再传入大陆。该毛刷的特点是洗净度较好，使用寿命短，易裹带沙砾。在洗车过程中如果车辆未经高压水枪作预处理，那么车身上的沙砾很容易会被裹在刷布里，在车身上留下很明显的划痕。布刷也容易卷带雨刮器，使用过程中需用胶带将雨刮器固定好，否则容易被损坏。但是由于该材料造价非常低廉，至今仍被部分厂家选用。在小型洗车机的使用过程中容易产生意外情况，该毛刷在国内流行不到两年，即逐渐被各大厂家弃用，目前主要应用于各类大型洗车设备。洗车机毛刷，特点是轻盈，洗净度高，脱水性好，尤其适合北方地区使用。同样泡沫刷也分国产和进口的区别，国产泡沫刷价格低廉，材质疏松，容易断裂，对车体接触的力度小，影响洗净度。国产泡沫刷基本上都被加工成细条状，非常不利于对车辆较脏的部位清洗。进口泡沫刷(产地多为美国)的材质紧密，耐磨度高。尤其是水平安装方式，有效地解决了泡沫刷的过柔特性，刷洗车辆时既能保护车漆面，又能提供足够的清洗力度，脱水性能也明显优于国产泡沫刷，但其高昂的进口价格无法让大部分洗车机厂商接受。
目前，市场上的全自动洗车机对车身基本上没有什么损害，但还是有很多车主认为毛刷会伤车身，这一点也能看到车主对爱车的关心程度。其实全自动洗车机所使用的毛刷都是质地柔软的，国外进口的高质量毛刷，更柔和的贴近车身，对车身零伤害。试想一下，如果毛刷真的伤车身，那怎么还会有全自动洗车机的存在与发展的，而如今，全自动洗车机已经逐渐代替了传统的洗车方式，成为了洗车的主流。从现如今的洗车方式也能看出毛刷到底伤不伤车了。