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沧州迟淑敏肛肠门诊的专家总结，引起肛门直肠狭窄的原因主要有以下五个方面：
1.先天因素 在胚胎发育阶段，直肠与肛管之间的肛门直肠膜发育失常，出生后此膜穿透不全或未消失，形成肛门直肠狭窄甚至锁闭，出生后肛门锁闭处理不当，也可形成狭窄。也有骶尾骨发育畸形而压迫肠腔者。
2.炎症 如溃疡性直肠炎、克罗恩病、肛周脓肿、复杂性肛瘘、肛管直肠结核、阿米巴肠病、吸血虫性肠病、性病性淋巴肉芽肿等，均可使肛管直肠结缔组织增生肥厚，形成瘢痕，导致管腔狭窄。
3.损伤 一是医源性损伤，如手术时切除肛管皮肤或者结扎痔粘膜过多，不适当注射坏死剂或硬化剂治疗痔疮、保肛术治疗低位直肠癌或痔上粘膜环切手术后吻合口愈合不良、盆腔放射治疗等。二是意外损伤，如肛门部的高处坠落、刀伤、枪伤、及异物损伤。三是理化损伤，如烧烫伤、强酸强碱损伤等。
4.肿物压迫 因肿物占据肛管直肠，如肛管直肠肿瘤、直肠巨大息肉等，或邻近器官肿物压迫，如阴道或子宫肿瘤，前列腺肿瘤、畸形瘤、脊索瘤、平滑肌肉瘤、骶骨前脊膜突出等。
5.肌肉痉挛 内括约肌、耻骨直肠肌及盆底肌群痉挛可引起功能性肛管直肠狭窄，又称假性狭窄。若肛管纤维变性、耻骨直肠肌肥厚，则为器质性狭窄，又称真性狭窄。